黑膜沼气池容积大、占地空间大，沼气属易燃、易爆且有毒气体，软体膜面易被尖锐、锋利金属器物割破。因此，黑膜沼气池选址应避免临近村庄、公路等行人易靠近场所，尽量选择养殖场下风向及比养殖场地势低的位置。
    沼气池底膜建议使用厚度1.0mm以上的土工膜进行铺设，铺HDPE防渗膜是整个防渗系统中一道关键的工序。铺设前，施工部门要会同有关部门对基底进行检查验收，并对HDPE防渗膜外观质量进行开包检查，记录并修补已发现的机械损伤和生产创伤、孔洞、折损等缺陷。丈量池体各部位尺寸后，按实际大小裁切HDPE防渗膜，并逐片编号作好记录，同时在施工场地平面图上编号，并确保编号对应一致。
    土工膜接缝搭接宽度≥100mm，使接缝排列方向平行于最大坡脚线，即沿坡度方向排列。底膜铺设完毕后，要检查铺设区域内的每片膜的编号与平面图上的编号一致，确认无误后用沙袋进行临时固定，然后检查膜片的搭接宽度，需要调整时及时调整，为下道工序作准备。
    池底膜片铺好后再顺次铺设边坡位置，在拐角等不规则处的膜片要裁成上宽下小的“倒梯形”，其宽窄比例操作人员应根据现场的实际情况和边坡的具体尺寸精确计算，若该比例把握不准，会导致边坡上的膜面“起鼓”或“悬空”。最后是接缝的焊接，管道跟土工膜的焊接是此环节的重点，要用挤压焊进行仔细包裹防止粘接不严。底膜铺设完成后，锚固沟膜面上填20cm厚素土固定，待顶膜铺设后，再用素土填平夯实。